Magyarország - Laboratóriumi szolgáltatások - MATE-Laboratóriumi szolgáltatások DBR-2025/II.név

A Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem, mint Ajánlatkérő „MATE Laboratóriumi szolgáltatások DBR” tárgyban, a közbeszerzésekről szóló 2015. évi CXLIII. törvény (továbbiakban: Kbt.) 107. § (1)-(5) bekezdései alapján Dinamikus Beszerzési rendszert hozott létreEKR001148422024 számon, az alábbi főbb kategóriákban: I. Állati -, állati eredetű minták és trágya vizsgálata II. Növényi minták (növényből, növényi anyagból, növényi alapú termékből származó minták) vizsgálata III. Vízvizsgálatok IV. Talaj és környezeti minták vizsgálata V. Molekuláris és biotechnológiai eljárások Ajánlatkérő a Kbt. 107.§ (2) bekezdése alapján a rendszerben megvalósítandó konkrét közbeszerzésekre vonatkozó pontos műszaki leírást és szerződéses feltételeket a DBR-ben részt vevő Ajánlattevők számára az ajánlattételi felhívás megküldésével egyidejűleg bocsátotta rendelkezésre. A jelen tájékoztatóban a 2025. II. negyedéves, a Dinamikus beszerzési rendszerben történt beszerzések lebonyolítására irányuló eljárásokat és azok eredményét teszi közzé Ajánlatkérő a Kbt. 37. § (4) bekezdése alapján. Ajánlatkérő az alábbi eljárásokat folytatta le: Laborszolgáltatás-01 - Szekvenálás 1, EKR szám: EKR000315722025 Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya: Baromfi béltartalom 16S rDNS alapú mikrobiális genom szekvenálás Vizsgálandó minták száma: 100 db egyedi minta és 36 db poolozott minta (72 egyedi mintából), összesen 136 db minta 2. Elvárt minimum követelmények: • A bakteriális DNS kivonása, majd további tisztítás a gyártó protokollja szerint. • Genomiális DNS koncentrációjának mérése és szükség esetén poolozása • A poolozott minták bakteriális genomi DNS amplifikálása, amely legalább a bakteriális 16S rDNS gén V3 - V4 régióját fedje le • 16S riboszómális RNS (16 S rDNS) gén alapú új generációs szekvenálás (NGS) • A PCR könyvtárak minőségi és mennyiségi meghatározása (Quality Control - QC) • A könyvtárak ekvimoláris szekvenálása Illumina MiSeq vagy azzal egyenértékű platformon, 300 bázispár olvasási hosszúságú párosított protokoll használatával. • A további bioinformatikai feldolgozásra is alkalmas nyers és bioinformaikailag előszűrt szekvenált adatok (FastQ fájlok), interaktív Krona ábrák és excel fájlok (Individual és Aggregate Summary) elküldése. A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása a megrendelő feladata. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv) megküldése elektronikus formában (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés). A teljesítés során elvárt: Vállalkozó, a részére átadott mintákból genomi DNS izolálást és PCR inhibítor eltávolítást végez. Az izolált genomi DNS minták kvantitálása után, a koncentrációk alapján Vállalkozó a párhuzamos mintákat poolozza. Vállalkozó a kapott eredményeket (koncentrációk) tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, riportokat a Megrendelő rendelkezésére bocsájtja. A 16 S riboszómális DNS (16 S rDNS) gén alapú új generációs szekvenálása (NGS). A szekvenálási eredmények elküldése olyan formában, amely további bioinformatikai feldolgozásra alkalmas Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 3. Teljesítés határideje: A minták átadására a szerződés hatálya alatt 1 alkalommal kerül sor. A mintaátadásra a szerződéskötést követő 10 naptári napon belül, a felek által előzetesen egyeztetett időpontban kerül sor. A teljesítési határidő a minták átadásától számított 42 naptári nap. Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.