Ελλάδα - Αντιδραστήρια εργαστηρίων - Προμήθεια Αντιδραστηρίων για τη Μονάδα Νευρογενετικής

Προμήθεια Αντιδραστηρίων για τις ανάγκες της Μονάδας Νευρογενετικής για χρονικό διάστημα είκοσι τεσσάρων (24) μηνών. Τμήμα 23 - NlaIII Ανασυνδυασμένη περιοριστική ενδονουκλεάση NlaIII, συγκέντρωσης 10.000 units/ml. Να κόβει αποτελεσματικά σε σύντομες πέψεις διάρκειας 5-15 λεπτών (Time saver) αλλά και σε πολύωρες πέψεις (overnight) χωρίς μείωση της ενεργότητάς της. Να έχει την δυνατότητα θερμικής απενεργοποίησης με επώαση στους 65°C για 20 min. Να παρέχεται με 10x ειδικό διάλυμα αντίδρασης rCutSmart στο οποίο να δρα με 100% απόδοση και επιπλέον Gel Loading Dye, Purple (6x). Το διάλυμα αντίδρασης να περιέχει 100 µg/ml ανασυνδυασμένη Albumin Molecular Biology Grade, αντί για BSA και να μπορεί να χρησιμοποιηθεί με 100% απόδοση σε όλες τις περιοριστικές ενδονουκλεάσες υψηλής πιστότητας. Συσκευασία: 500 units , ποσότητα 1500 (συσκευασία των 3).; Τμήμα 24 - NsiI-HF Ανασυνδυασμένη περιοριστική ενδονουκλεάση NsiI-HF , συγκέντρωσης 20.000 units/ml. Να είναι υψηλής πιστότητας (high-fidelity) για ελαχιστοποιημένο star activity, να κόβει αποτελεσματικά σε σύντομες πέψεις διάρκειας 5-15 λεπτών (Time saver) αλλά και σε πολύωρες πέψεις (overnight) χωρίς μείωση της ενεργότητάς της. Να έχει την δυνατότητα θερμικής απενεργοποίησης με επώαση στους 80°C για 20 min. Να παρέχεται με 10x ειδικό διάλυμα αντίδρασης rCutSmart στο οποίο να δρα με 100% απόδοση και επιπλέον Gel Loading Dye, Purple (6x). Το διάλυμα αντίδρασης να περιέχει 100 µg/ml ανασυνδυασμένη Albumin Molecular Biology Grade, αντί για BSA και να μπορεί να χρησιμοποιηθεί με 100% απόδοση σε όλες τις περιοριστικές ενδονουκλεάσες υψηλής πιστότητας. Συσκευασία: 1.000 units, ποσότητα 3000 (συσκευασία των 3); Τμήμα 25 - Taq DNA πολυμεράση ανασυνδυασμένη, για ενίσχυση τμημάτων DNA μήκους έως 5 Kb. Να έχει συγκέντρωση 5u/μl και να συνοδεύεται από κατάλληλο 10Χ ρυθμιστικό διάλυμα και ξεχωριστό διάλυμα Mg συγκέντρωσης 25 - 50 mM. Συσκευασία των 500 units, ποσότητα 10.000 (συσκευασία των 20).; Τμήμα 26 - Σύνθεση εκκινητών 20-25 βάσεων, σε ποσότητα 40 nmol, αφαλατωμένων. Η σύνθεση να είναι βασισμένη σε χημεία φωσφοραμιδίτης με αποδοτικότητα παραπάνω από 99,5%. Η εταιρία σύνθεσης να είναι πιστοποιημένη κατά ISO 9001:2015 και ISO 13485:2016. Ο χρόνος παράδοσης να μην ξεπερνάει τις 3-4 εργάσιμες ημέρες Οι εκκινητές είναι ανά βάση, ποσότητα: 2.000 βάσεις.; Τμήμα 27 - Αντιδραστήριο για ανάλυση αλληλουχίας DNA. Να βασίζεται στην χημεία σημασμένων διδεοξυνουκλεοτιδίων, τεσσάρων χρωστικών (BigDye Terminators ). Να περιλαμβάνει πλασμίδιο ελέγχου pGEM και εκκινητή Μ13 ,συσκευασία 100 rxns, ΚΙΤ 100 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ, Ποσότητα 4; Τμήμα 28 - Πολυμερές ακρυλαμίδης σε κλειστή συσκευασία για αυτοματοποιημένη πλήρωση των τριχοειδών κατάλληλο για τεχνολογία τριχοειδούς ηλεκτροφόρησης, και εφαρμογές αλληλούχισης-προσδιορισμού μήκους θραύσματος DNA, VIAL 960 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ, ποσότητα 6.; Τμήμα 29 - Μάρτυρας μεγέθους έως 1000bp το οποίο να περιέχει τμήματα DNA εύρους 47-946 bp, σημασμένα με φθορίζουσες χρωστικές για χρήση σε ηλεκτροφόρηση σε γενετικό αναλυτή, συσκευασία 400 δειγμάτων, VIAL 400 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ, ποσότητα 2.; Τμήμα 30 - Μάρτυρας μεγέθους έως 1000bp το οποίο να περιέχει τμήματα DNA εύρους 35-500 bp, σημασμένα με φθορίζουσες χρωστικές για χρήση σε ηλεκτροφόρηση σε γενετικό αναλυτή, συσκευασία 800 δειγμάτων, VIAL 800 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ, ποσότητα 10; Τμήμα 31 - Διάλυμα υψηλής ποιότητας απιονισμένο φορμαμίδιο για την αποδιάταξη και προετοιμασία των δειγμάτων. Να είναι συμβατό με τεχνολογία ηλεκτροκινητικής έγχυσης DNA σε τριχοειδή ηλεκτροφόρηση. Να διατίθεται σε συσκευασία 25 ml, ποσότητα 100 (συσκευασία των 4).; Τμήμα 32 - Κιτ που να περιέχει τα αντιδραστήρια και τα υλικά που απαιτούνται για την εκτέλεση των ακόλουθων βημάτων στη ροή εργασίας αλληλούχισης επόμενης γενιάς • προετοιμασία εμπλουτισμένων, template-positive Ion Sphere™ Particles και φόρτωμα σε ένα Ion 540 ™ Chip χρησιμοποιώντας το σύστημα Ion Chef. • Αλληλούχιση των φορτωμένων Chips σε ένα Sequencer Ion S5 ™, Sequencer Ion S5 ™ XL ή Ion GeneStudio ™ S5 Series Sequencer. Κάθε κιτ να περιέχει όλα τα υλικά που απαιτούνται για το φορτωμα και την αλληλούχιση 8 chips και να είναι συμβατό για χρήση με βιβλιοθήκες μέχρι 200 βάσεων. Κιτ 8 αντιδράσεων / ποσότητα: 6 Κιτ.; Τμήμα 33 - Κιτ 16 μοναδικά σημασμένων ολιγονουκλεοτιδίων (Barcodes) κατάλληλων για τη δημιουργία βιβλιοθηκών DNA. Να επιτρέπει την ταυτόχρονη ανάμιξη βιβλιοθηκών DNA από 16 διαφορετικά δείγματα πριν από την κλωνική ενίσχυση των βιβλιοθηκών σε σφαιρίδια με PCR σε γαλάκτωμα για διεξαγωγή ταυτόχρονης πολλαπλής αλληλούχισης των βιβλιοθηκών με τεχνολογία ημιαγωγών. Kit των 160 αντιδράσεων. ΚΙΤ 160 ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ, ποσότητα 2.; Τμήμα 34 - Ion 540 Chip Kit Chip κατάλληλα για χρήση με τα συστήματα της σειράς Ion S5, 60-80M reads/chip Συσκευασία 8 chips/ ποσότητα: 1 συσκευασία.; Τμήμα 35 - ΚΙΤ αντιδραστηρίων για την μέτρηση της συγκέντρωσης dsDNA σε φθοριόμετρο Qubit. Εύρος ποσοτικοποίησης 0,2-100 ng. Συσκευασία 100 αντιδράσεων, ποσότητα 2.; Τμήμα 36 - Έτοιμα προς χρήση μαγνητικά σφαιρίδια που παρέχουν βελτιστοποιημένη επιλογή μεγέθους και καθαρισμό PCR, αφαιρώντας μικρά θραύσματα όπως dNTP, άλατα, εκκινητές και διμερή εκκινητών. Να είναι κατάλληλο για εφαρμογές NGS Cleanup, PCR Cleanup, PCR Purification, DNA Purification και Sequencing. Το πρωτόκολλο καθαρισμού να έχει βελτιστοποιηθεί για θραύσματα DNA μεγαλύτερα από 90 bp, με ποσοστό ανάκτησης >90%. Να αποθηκεύονται σε θερμοκρασία δωματίου και να προσφέρονται σε συσκευασία 50ml. / ποσότητα: 100 ml (2 συσκευασίες); Τμήμα 37 - Kit για καθαρισμό Dye terminators από μίγματα αντιδράσεων sequencing με spin columns: Να επιτυγχάνει αποτελεσματική απομάκρυνση των dye terminators (π.χ. BigDye™ terminators) χωρίς κατακρίμνηση με αιθανόλη. Η απομάκρυνση να γίνεται με κολώνες φυγοκέντρησης (spin columns). Να περιέχει σωληνάρια συλλογής των 2 ml. Κάθε κολώνα να είναι κατάλληλη για καθαρισμό ποσότητας τουλάχιστον 20μl από το μείγμα της αντίδρασης sequencing. Ο χρόνος καθαρισμού να είναι μέχρι 5 λεπτά για κάθε δείγμα. Να διατίθεται σε συσκευασία των 250 αντιδράσεων/καθαρισμών, kit 250 αντιδράσεων/καθαρισμών, ποσότητα 3.; Τμήμα 38 - Κιτ απομόνωσης DNA από αντίδραση PCR ή πήκτωμα αγαρόζης/250 αντιδράσεις: Καθαρισμός PCR προϊόντος και gel extraction να επιτυγχάνονται με το ίδιο kit χρησιμοποιώντας το ίδιο buffer. Η διαδικασία να επιτυγχάνεται σε λιγότερο από 15 λεπτά. Να παρέχει υψηλή ανάκτηση DNA ακόμα και από πολύ μικρά κομμάτια (>50bp). Να επιτυγχάνεται πλήρης απομάκρυνση των primers. Να είναι δυνατοί μικροί όγκοι έκλουσης από 15 μl μέχρι 30 μl. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία Silica Membrane με spin columns. Να παρέχει DNA έτοιμο προς χρήση, κατάλληλο για κλωνοποίηση, sequencing, PCR, transformation, restriction analysis. Να είναι δυνατή η απομόνωση ssDNA και SDS-containing samples. Να περιλαμβάνει διάλυμα δέσμευσης του DNA με δείκτη pH για βέλτιστη απόδοση του kit. Να περιλαμβάνει κολόνες, και όλα τα απαραίτητα buffers. Να είναι κατάλληλο και για χρήση με συσκευή κενού (vacuum manifold). Να διατίθεται σε συσκευασία των 250 αντιδράσεων/καθαρισμών, kit 250 αντιδράσεων/καθαρισμών, ποσότητα 2.; Τμήμα 39 - Πιστοποιημένο Kιτ για την ανίχνευση επαναλήψεων GAA στο πρώτο εσώνιο του γονιδίου φραταξίνης (FXN), οι οποίες αποτελούν την κύρια αιτία της νόσου Friedreich's Ataxia (FA). Μπορεί να δείξει τόσο την επέκταση των επαναλήψεων σε πάσχοντα άτομα όσο και σε φορείς της νόσου. Ανιχνεύει το μέγεθος της επέκτασης, με capillary electrophoresis λιγότερες από 220 επαναλήψεις και με δυνατότητα ανίχνευσης περισσότερων των 220 επαναλήψεων σε gel agarose, προσδιορίζοντας έτσι με ακρίβεια τη σοβαρότητα της νόσου. Το κιτ περιέχει όλα τα απαραίτητα αντιδραστήρια τόσο για capillary electrophoresis όσο και για το gel agarose. Προδιαγραφές: • διαθέτει σήμανση CE-IVD • βασίζεται στη μέθοδο PCR με χρήση φθορισμού για την ανίχνευση επαναλήψεων GAA στο πρώτο εσώνιο του γονιδίου φραταξίνης (FXN) • ανιχνεύει τόσο την επέκταση των επαναλήψεων σε πάσχοντα άτομα όσο και σε φορείς της νόσου • ανιχνεύει το μέγεθος της επέκτασης, προσδιορίζοντας τη σοβαρότητα της νόσου • έχει ενσωματωμένο panel και bins για την ανάλυση των αποτελεσμάτων που καθιστούν εύκολη την ερμηνεία των επαναλήψεων και τον καθορισμό των αλληλομόρφων. • είναι συμβατό με συστήματα γενετικού αναλυτή Applied Biosystems® 3130/3130xl, 3500/3500xl ή Spectrum Compact CE System Promega. • το δείγμα DNA μπορεί να έχει απομονωθεί από ολικό αίμα ή αμνιακό υγρό ή χοριακές λάχνες ή να είναι ελεύθερο DNA σε αμνιακό υγρό. • να γίνεται πλήρης ανάλυση 5-χρωμάτων (5-dye fragment analysis) με τριχοειδή ηλεκτροφόρηση (capillary electrophoresis). • το κιτ περιέχει όλα τα αντιδραστήρια που απαιτούνται για την ανάλυση 50 δειγμάτων, όπως 1200 Size Standard, Matrix Standard καθώς και PCR Mix, Primer Mixes, Extend Long DNA Polymerase, Enhancer Buffer, Control DNA, Carrier Control. Κιτ για 50 αντιδράσεις, ποσότητα 3.; Τμήμα 40 - Έτοιμο μίγμα για PCR. Να είναι κατάλληλο για πολλαπλασιασμό σύνθετων GC-rich δειγμάτων, που δεν μπορούν να πολλαπλασιαστούν με συμβατικές τεχνικές PCR. Να είναι κατάλληλο για πολλαπλασιασμό τμημάτων μέχρι 6 Kb, χωρίς λάθη. Να περιέχει Advantage 2 Polymerase Mix, GC-Melt Reagent, και buffer με DMSO. Να διατίθεται σε συσκευασία για 100 αντιδράσεις, Kit των 100 αντιδράσεων, ποσότητα 6.; Τμήμα 41 - Προπαρασκευασμένο μείγμα για PCR υψηλής πιστότητας. Να έχει συγκέντρωση τουλάχιστον 2X. Να περιλαμβάνει στο ίδιο μείγμα Hi Fidelity πολυμεράση θερμής έναρξης (0,5 units ανά 25 μl αντίδρασης), MgCl2 (25mM σε 1Χ) και dNTPs (0,3 mM σε 1Χ) ώστε για την πραγματοποίηση της αντίδρασης να αρκεί η προσθήκη του DNA-μήτρα (template DNA) και των εκκινητών. Να είναι κατάλληλο για τον πολλαπλασιασμό τμημάτων έως και 15 kb όταν ως μήτρα χρησιμοποιείται γονιδιωματικό DNA. Να έχει συχνότητα σφάλματος (error rate) 3,6 x 10^6 ή καλύτερη. Η ενεργοποίηση της πολυμεράση θερμής έναρξης (hot start) με έκθεση στην υψηλή θερμοκρασία να ολοκληρώνεται σε 20 sec ή λιγότερο. Σε συσκευασία των 100 αντιδράσεων των 25μl, Kit των 100 αντιδράσεων, ποσότητα 3.; Τμήμα 42 - Πολυμεράση κατάλληλη για ενίσχυση μικρών , μεσαίων και μεγάλων τμημάτων DNA με αυξημένη πιστότητα. Να είναι antibody-based HotStart DNA Πολυμεράση για ελαχιστοποίηση παραπροϊόντων. Να διαθέτει 2x - 4x μεγαλύτερη πιστότητα από την Taq πολυμεράση. Να έχει συγκέντρωση2.5 U/μl. Να είναι κατάλληλη και για την ενίσχυση μικρής αρχικής ποσότητας DNA. Η συσκευασία να περιλαμβάνει: 5x LongRange Buffer 25 mM MgCl2 διάλυμα dNTP Μείγμα (10 mM το κάθε ένα) Το Kit να διατίθεται σε συσκευασία των 100 units, Kit των 100 units, ποσότητα 4.; Τμήμα 43 - Έτοιμο μίγμα πολυμεράσης και dNTPs για PCR (2Χ), με δύο inner tracking dyes. Να είναι μίγμα πολυμεράσης Hot Start με modified archaeal (Type B) DNA polymerase Η πολυμεράση να είναι κατάλληλη για ενίσχυση έως και 20 kb με εξαιρετική ευαισθησία και αυξημένη πιστότητα. Να διαθέτει 3x - 4x μεγαλύτερη πιστότητα από την Taq πολυμεράση. Να είναι κατάλληλη και για την ενίσχυση μικρής αρχικής ποσότητας DNA. Να διατίθεται σε συσκευασία των 100 αντιδράσεων (όγκου 25 μl), Kit των 100 αντιδράσεων, ποσότητα 5.; Τμήμα 44 - Κιτ για απομόνωση ολικού DNA (συμπεριλαμβανομένου γενομικού, μιτοχονδριακού και ιικού DNA) από έως και 400μl αρχικό δείγμα αίματος, ορού, πλάσματος και buffy coat. Να είναι κατάλληλο για χρήση στο αυτόματο μηχάνημα MagCore. Να είναι κατάλληλο για απομόνωση DNA από αίμα που έχει επεξεργαστεί με sodium citrate, EDTA, lithium heparin, sodium fluoride. Να χρησιμοποιεί τεχνολογία magnetic beads. Όλα τα απαραίτητα buffers, μαγνητικά σφαιρίδια και Proteinase K να περιέχονται σε προγεμισμένες κασέτες. Να παρέχεται υψηλής καθαρότητας DNA: A260/280 > 1.85. Ο όγκος έκλουσης να είναι από 60 έως 200 μl. Η διαδικασία να ολοκληρώνεται σε λιγότερο από 60 λεπτά. Να διατίθεται σε συσκευασία των 96 αντιδράσεων/απομονώσεων,kit για 96 αντιδράσεις /απομονώσεις, ποσότητα 24.; Τμήμα 45 - Πιστοποιημένο Κιτ για την ανίχνευση και ενίσχυση CGG επαναλήψεων στην 5' αμετάφραστη περιοχή (5' UTR) του γονιδίου FMR1 (Fragile X mental retardation 1). Το κιτ συμβάλλει στη διάγνωση του συνδρόμου του εύθραυστου Χ (Fragile X syndrome) και άλλων σχετικών με το εύθραυστο Χ διαταραχών, όπως η πρωτοπαθής ωοθηκική ανεπάρκεια που σχετίζεται με το εύθραυστο Χ (FXPOI) και το σύνδρομο τρόμου/αταξίας που σχετίζεται με το εύθραυστο Χ (FXTAS), καθώς και στην ταυτοποίηση φορέων του συνδρόμου εύθραυστου Χ. Το kit χρησιμοποιεί τρεις εκκινητές (primers), που περιλαμβάνουν ζεύγος εκκινητών ειδικών για τη θέση (forward και reverse) και έναν εκκινητή με πολλαπλές θέσεις πρόσδεσης μέσα στις επαναλήψεις CGG. Οι ειδικοί εκκινητές για τη θέση ενισχύουν τα πλήρους μήκους γονιδιακά προϊόντα, ενώ ο εκκινητής CGG παράγει τις χαρακτηριστικές κορυφές στο ηλεκτροφορητικό διάγραμμα από τα αλληλόμορφα με επεκτάσεις CGG. Tο μέγεθος των προϊόντων PCR πλήρους μήκους μετατρέπεται σε αριθμό επαναλήψεων CGG χρησιμοποιώντας συγκεκριμένο μαθηματικό τύπο ο οποίος παρέχεται και η κατηγοριοποίηση των αλληλομόρφων μπορεί να καθοριστεί με ακρίβεια βάσει τον αριθμού επαναλήψεων CGG. Προδιαγραφές: • διαθέτει σήμανση CE-IVD • μέθοδος PCR με χρήση φθορισμού για την ανίχνευση τριπλετών, ακολουθούμενη από τριχοειδική ηλεκτροφόρηση (capillary electrophoresis) με χρήση γενετικού αναλυτή για μέτρηση του μεγέθους των θραυσμάτων. • έχει ενσωματωμένο panel και bins για την ανάλυση των αποτελεσμάτων που καθιστούν εύκολη την ερμηνεία των επαναλήψεων και τον καθορισμό των αλληλομόρφων. • συμβατό με συστήματα γενετικού αναλυτή Applied Biosystems® 3130/3130xl, 3500/3500xl ή 3730, 3730xl DNA. • δείγμα να είναι DNA να έχει απομονωθεί από ολικό αίμα. • Το κιτ περιέχει όλα τα αντιδραστήρια που απαιτούνται για την ανάλυση 100 δειγμάτων, όπως ROX 1000 Size Ladder, FMR1 Primer Mix, GC-Rich Amp Buffer, Polymerase Mix. Κιτ για 100 αντιδράσεις, ποσότητα .; Τμήμα 46 - Πιστοποιημένο Κιτ για την ανίχνευση των επαναλήψεων CTG στην μη κωδική περιοχή του γονιδίου DMPK που σχετίζονται με τη Νόσο Μυοτονικής Δυστροφίας τύπου 1 (MD1). Προσδιορίζεται το μέγεθος της επέκτασης, υποδεικνύοντας έτσι τη σοβαρότητα της νόσου. Πραγματοποιείται ανάλυση θραυσμάτων χρησιμοποιώντας τριχοειδή ηλεκτροφόρηση (capillary electrophoresis) και ο αριθμός των επαναλήψεων υπολογίζεται με συγκεκριμένο τύπο. Προδιαγραφές: • διαθέτει σήμανση CE-IVD. • να γίνεται πλήρης ανάλυση 5-χρωμάτων (5-dye fragment analysis) με τριχοειδή ηλεκτροφόρηση (capillary electrophoresis). • έχει ενσωματωμένο panel και bins για την ανάλυση των αποτελεσμάτων που καθιστούν εύκολη την ερμηνεία των επαναλήψεων και τον καθορισμό των αλληλομόρφων για τον προσδιορισμό της σοβαρότητας της νόσου ανάλογα με τον αριθμό των επαναλήψεων. • είναι συμβατό με τα συστήματα γενετικού αναλυτή Applied Biosystems® 3130/3130xl, 3500/3500xl. • δείγμα DNA που έχει απομονωθεί από ολικό αίμα ή αίμα από filter paper (DBC™) ή αραιωμένο αίμα με το ειδικό lysis buffer που περιέχεται στο κιτ. • Το κιτ περιέχει όλα τα αντιδραστήρια που απαιτούνται για την ανάλυση 50 δειγμάτων, όπως 600 Size Standard, Matrix Standard, PCR Mix, polymerase, Control DNA & Primer mix. Κιτ για 50 αντιδράσεις, ποσότητα 2.; Τμήμα 47 - Έτοιμο προς χρήση πιστοποιημένο Κιτ, κατάλληλο για In Vitro διαγνωστική χρήση για την ανίχνευση των επαναλήψεων της τριπλέτας CAG στους τύπους 1,2,3,6 και 7, καθώς και των CTA/CTG επαναλήψεων στον τύπο SCA 8 της νωτιαιοπαρεγκεφαλιδικής αταξίας. Το Κιτ βασίζεται στην τεχνολογία PCR - fluorescent fragment Analysis και είναι συμβατό με τους γενετικούς αναλυτές ABI: 3130, 3730 & 3500. Κιτ για 16 αντιδράσεις, ποσότητα 8.