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Deutschland - Ausrüstung für Immunoanalysen - Konzept zur Durchführung von Next Generation Sequencing (NGS)

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Die Klinikum Chemnitz gGmbH beschafft ein Konzept zur Durchführung von Next Generation Sequencing (NGS) für ihr Institut für Pathologie in Chemnitz, in dem derzeit rund 400 bis 500 Sequenzierungen von Tumormarkern pro Jahr erfolgen, mit steigender Tendenz auf 650 bis 700. Gefordert werden unter anderem DNA- und RNA-Analysen aus FFPE und Liquid Biopsy, Sequenzierung von mehr als 500 Biomarkern, WES-Sequenzierung, ein offenes vollautomatisches System sowie drei Referenzen. Es handelt sich um ein Verhandlungsverfahren.

Beschreibung

Konzept zur Durchführung von Next Generation Sequencing (NGS) Die Klinikum Chemnitz gGmbH betreibt im Institut für Pathologie eine Molekular-Pathologie, in der aktuell ca. 400 bis 500 Sequenzierungen pro Jahr von Tumormarkern durchgeführt werden. Es wird eingeschätzt, dass die Anzahl auf 650 bis 700 pro Jahr steigen wird. Die Hochdurchsatz-Sequenzierung (Next-Generation-Sequencing, NGS) ist heute Standard in der molekularen Diagnostik, da sie die gleichzeitige Analyse hunderter Gene bzw. Biomarkern erlaubt. Die Identifikation von genetischen Veränderungen in Gewebe und Blut bildet das Fundament der personalisierten Präzisionsonkologie, um zielgerichtete Therapien exakt an das molekulare Biomarkerprofil eines Tumors anzupassen. Das Institut für Pathologie soll mit einem Sequenziergerät ausgestattet werden, das es ermöglicht mit den sich schnell entwickelnden Anforderungen und Vorgaben des Berufsverbandes Deutscher Pathologinnen und Pathologen e.V. (BDP) und der Deutschen Gesellschaft für Pathologie (DGP) zu entsprechen. Dazu soll im Verhandlungsverfahren eine konzeptionelle Lösung angeboten werden, die folgende Mindestanforderungen beinhaltet: • Ermittlung genetischer Alterationen auf DNA- und RNA-Ebene (aus FFPE, Liquid Biopsy • Sicherstellung von Ringversuchen • Sarkom-Diagnostik auf Basis spezifischer Genfusio-Bestimmung • Sequenzierung von mehr als 500 Biomarkern (HRD, TMB, MSI) • Möglichkeit der WES-Sequenzierung • Kompatibilität für den Einsatz von Fremd-Assays „Offenes System“ • Vollautomatisches System • Möglichkeit zur Darstellung polyrepetiver Sequenz-Bereiche • Datenauswertung und Datenanalyse Aufgrund der Komplexität der Umstellung des NGS wird mit einer erheblichen Einarbeitungsphase gerechnet, die in ihrem zeitlichen Ausmaß noch nicht beziffert werden kann. Wir erwarten von den Bewerbern/Bietern höchste fachliche Expertise, die in 3 Referenzen (Anforderungen siehe Formular KCLW-V13 Eigenerklärung zur Eignung) nachzuweisen ist.

Amtliche Quelle

Quelle: TED - Tenders Electronic Daily (Publications Office of the EU)

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