Magyarország - Laboratóriumi szolgáltatások - MATE-Laboratóriumi szolgáltatások DBR-2026/III.név

A Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem, mint Ajánlatkérő „MATE Laboratóriumi szolgáltatások DBR” tárgyban, a közbeszerzésekről szóló 2015. évi CXLIII. törvény (továbbiakban: Kbt.) 107. § (1)-(5) bekezdései alapján Dinamikus Beszerzési rendszert hozott létre EKR001148422024 számon, az alábbi főbb kategóriákban: I. Állati -, állati eredetű minták és trágya vizsgálata II. Növényi minták (növényből, növényi anyagból, növényi alapú termékből származó minták) vizsgálata III. Vízvizsgálatok IV. Talaj és környezeti minták vizsgálata V. Molekuláris és biotechnológiai eljárások Ajánlatkérő a Kbt. 107.§ (2) bekezdése alapján a rendszerben megvalósítandó konkrét közbeszerzésekre vonatkozó pontos műszaki leírást és szerződéses feltételeket a DBR-ben részt vevő Ajánlattevők számára az ajánlattételi felhívás megküldésével egyidejűleg bocsátotta rendelkezésre. A jelen tájékoztatóban a 2026. III. negyedéves, a Dinamikus beszerzési rendszerben történt beszerzések lebonyolítására irányuló eljárásokat és azok eredményét teszi közzé Ajánlatkérő a Kbt. 37. § (4) bekezdése alapján. Ajánlatkérő az alábbi eljárást folytatta le: Laborszolgáltatás-07 - Amplikon szekvenálás (2 rész), EKR szám: EKR001140312026 Laborszolgáltatás-08 - Újgenerációs szekvenálások (2 rész), EKR szám: EKR001144332026 Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási keretszerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya, leírása 42 db DNS minta 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálása. A szolgáltatás igénybevételéhez szükséges közösségi DNS mintákat Ajánlatkérő biztosítja, minimum 20 μL és ≥10 ng/μl koncentráció mennyiségben (azaz mintánként ≥200 ng összes DNS). A szekvenálás hal, víz és egyéb akvakultúrás eredetű DNS mintákból történik. Elvárt minimum követelmények: 1. A 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálása Illumina NovaSeq, vagy azzal egyenértékű platformon PCR, könyvtár készítés, szekvenálás 2 x 300 bp readhosszal és mintánként legalább 100.000 Forward és 100.000 Reverse read lefedettséggel. 2. A FastQC Report-ok alapján a szekvenálás során elvárt minimum 80% Q30 minőségi érték minden readre. 3. Adatok és minták megőrzése a vizsgálat elvégzését követően legalább 3 hónapig. 4. A beérkező minták minőségi ellenőrzése. A minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, elektronikus fileként Megrendelő rendelkezésére kell bocsátani. A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása Ajánlatkérő feladata. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv): a vizsgálati eredmények elektronikus úton eljuttatott (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés), továbbá Ajánlatkérő erre irányuló igénye esetén hivatalos (hitelesített, nyertes ajánlattevő által aláírt, papír alapú) összefoglaló rövid kivonata, amely jegyzőkönyvként szolgál. A nyertes ajánlattevő köteles az eredményeket és a kapcsolódó, előírt információkat elektronikus úton továbbá a hivatalos jegyzőkönyvet elektronikus formában az Ajánlatkérő részére a megadott kapcsolattartó e-mail címére is megküldeni, illetve hivatalos, papír alapú összefoglaló dokumentum igénylése esetén a hivatalos, papír alapú dokumentumot az Ajánlatkérő kapcsolattartójának megadott postacímére megküldeni. Az ezzel kapcsolatos költségeket a vizsgálati díj magában foglalja. A teljesítés során elvárt: Alap bioinformatikai értékelés (FastQC report) és leírása: Az alkalmazott eszközök, módszerek és programok részletes leírása (cikkekben Anyag Módszerként beilleszthető legyen) szükséges. Az alkalmazott eszközök (berendezés típusa), kémia (felhasznált kitek), módszerek (minőség-ellenőrzés, könyvtárkészítés, analízis lépések) és programok (szekvencia generáló, minőségellenőrző, statisztikai és elemző programok) felsorolása szükséges paraméterekkel együtt. A mintákhoz tartozó nyers readek (nyers FASTQ file-ok) elküldése a Megrendelőnek elektronikus formában. Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 2. Teljesítés határideje: A minták átadásának lehetséges legkésőbbi időpontja: 2026.10.15. A minták átadására a szerződés hatálya alatt - a minták begyűjtésének függvényében - legfeljebb 2 (két) alkalommal kerül sor, egy alkalommal ajánlatkérő min. 5 db minta átadását vállalja. Az első mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap. A mintaátadások időpontját Ajánlatkérő jogosult meghatározni azzal, hogy a mintaátadás időpontjáról a nyertes ajánlattevőt legalább 3 naptári nappal korábban írásban köteles tájékoztatni (megrendelés). A teljesítési határidő a minták átadásától számított 30 munkanap, de legkésőbb 2026. 11.30., a finanszírozást biztosító projekt záró időpontjára figyelemmel (amely időpont előbb bekövetkezik). Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási keretszerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya és mennyisége: 192 db DNS minta 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálása. A szolgáltatás igénybevételéhez szükséges közösségi DNS mintákat az Ajánlatkérő biztosítja, minimum 20 μL és ≥ 10 ng/μl koncentráció mennyiségben (azaz mintánként ≥ 200 ng összes DNS). A szekvenálás hígtrágya szeparált frakciókból és hormontartalmú mikrobiális dúsítóközegből, illetve vizes közegekből származó DNS mintákból történik. Opcionálisan ajánlatkérő további legfeljebb 50 db DNS minta tekintetében jogosult a szolgáltatás megrendelésére. Elvárt minimum követelmények: 1. A 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálása Illumina NovaSeq,vagy azzal egyenértékű platformon PCR, könyvtár készítés, szekvenálás 2 x 300 bp readhosszal és mintánként legalább 100.000 Forward és 100.000 Reverse read lefedettséggel. 2. A FastQC Report-ok alapján a szekvenálás során elvárt minimum 80% Q30 minőségi érték minden readre. 3. Adatok és minták megőrzése a vizsgálat elvégzését követően legalább 3 hónapig. 4. A beérkező minták minőségi ellenőrzése. A minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, elektronikus fileként Megrendelő rendelkezésére kell bocsátani. A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása az Ajánlatkérő feladata. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv): a vizsgálati eredmények elektronikus úton eljuttatott (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés), továbbá Ajánlatkérő erre irányuló igénye esetén hivatalos (hitelesített, nyertes ajánlattevő által aláírt, papír alapú) összefoglaló rövid kivonata, amely jegyzőkönyvként szolgál. A nyertes ajánlattevő köteles az eredményeket és a kapcsolódó, előírt információkat elektronikus úton továbbá a hivatalos jegyzőkönyvet elektronikus formában az Ajánlatkérő részére a megadott kapcsolattartó e-mail címére is megküldeni, illetve hivatalos, papír alapú összefoglaló dokumentum igénylése esetén a hivatalos, papír alapú dokumentumot az Ajánlatkérő kapcsolattartójának megadott postacímére megküldeni. Az ezzel kapcsolatos költségeket a vizsgálati díj magában foglalja. A teljesítés során elvárt: Alap bioinformatikai értékelés (FastQC report) és leírása: Az alkalmazott eszközök, módszerek és programok részletes leírása (cikkekben Anyag Módszerként beilleszthető legyen) szükséges. Az alkalmazott eszközök (berendezés típusa), kémia (felhasznált kitek), módszerek (minőség-ellenőrzés, könyvtárkészítés, analízis lépések) és programok (szekvencia generáló, minőségellenőrző, statisztikai és elemző programok) felsorolása szükséges paraméterekkel együtt. A mintákhoz tartozó nyers readek (nyers FASTQ file-ok) elküldése a Megrendelőnek elektronikus formában. Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 2. Teljesítés határideje: A minták átadásának lehetséges legkésőbbi időpontja: 2027.11.30. A minták átadására a szerződés hatálya alatt - a minták begyűjtésének függvényében - legalább 6 (hat), de legfeljebb 9 (kilenc) alkalommal kerül sor, egy alkalommal ajánlatkérő min. 20 db minta átadását vállalja. Az első mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap. A mintaátadások időpontját Ajánlatkérő jogosult meghatározni azzal, hogy a mintaátadás időpontjáról a nyertes ajánlattevőt legalább 3 naptári nappal korábban írásban köteles tájékoztatni (megrendelés). A teljesítési határidő a minták átadásától számított 30 munkanap, de legkésőbb 2028.01.31., a finanszírozást biztosító projekt záró időpontjára figyelemmel (amely időpont előbb bekövetkezik). Ajánlatkérő előteljesítést elfogad. Ajánlatkérő az ajánlattételi felhívás II.2.4. pontban meghatározott alapmennyiségen (192 db minta) felül további legfeljebb 50 db minta, mint opciós mennyiség erejéig jogosult további minták vizsgálatának írásbeli megrendelésére legkésőbb az utolsó mintaszállítás megrendelésével (időpontjának megjelölésével) egyidőben, melynek határideje az utolsó szállítási alkalmat megelőző legalább 3 naptári nap. Ajánlatkérő egyoldalúan jogosult dönteni az opció igénybevételéről, azon belül a ténylegesen igényelt mennyiségéről. Ajánlatkérő az opciós mennyiség igénylésére, kimerítésére kötelezettséget nem vállal. Az opció igénybevétele esetén a Megrendelő a vizsgálathoz a mintákat az alapmennyiség utolsó szállítási alkalmába tartozó mintamennyiséggel egyidőben adja át (alapmennyiség utolsó részletének átadására és opciós mennyiségbe tartozó minták átadására egyszerre kerül sor). Az opció igénylése a teljesítési határidőt nem érinti (az opciós mennyiség teljesítési határideje is a minták átadásától számított 30 munkanap, de legkésőbb 2028.01.31., a finanszírozást biztosító projekt záró időpontjára figyelemmel (amely időpont előbb bekövetkezik)) és az opciós mennyiségre vonatkozó egységárnak az alapmennyiségre megadott egységárral meg kell egyeznie.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási keretszerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya, leírása 460 DNS minta 16S rDNS V3-V4, 90 db minta ITS2 régióinak amplikon, valamint 4 db baktériumtörzs DNS teljes genom szekvenálása. Opcionálisan ajánlatkérő további legfeljebb 50 db DNS minta 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálásának megrendelésére jogosult. Az amplikon szekvenálás igénybevételéhez szükséges közösségi DNS mintákat az Ajánlatkérő biztosítja, minimum 20 μL és ≥10 ng/μl koncentráció mennyiségben (azaz mintánként ≥200 ng összes DNS). A bakteriális genomszekvenáláshoz szükséges DNS mintákat is az Ajánlatkérő szolgáltatja. A beküldött DNS koncentrációja várhatóan ≥50 ng/μl, minimális térfogata ≥20 μl (azaz mintánként ≥1 μg összes DNS). A bakteriális genomok várható mérete 3-7 Mb. 1. Részfeladat: 90 db háttértalaj DNS ITS2 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2026.12.01. 2. Részfeladat: 90 db háttértalaj DNS, 90 db rhizozféra talaj DNS és 90 db gyökér endofita DNS 16S V3-V4 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2026.12.01. 3. Részfeladat: 4 db baktériumtörzs DNS teljes genom szekvenálása. A minták átadásának határideje : 2027.12.01. 4. Részfeladat: 10 db háttértalaj DNS, 90 db rhizoszféra talaj DNS és 90 db gyökér endofita DNS 16S V3-V4 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2028.12.01. A gyökér endofita minták esetén mPNA (mitokondriális) és pPNA (plasztisz- peptid nuklein sav) kapcsokat kell a reakcióhoz hozzáadni, ezek a növényi DNS amplifikációját gátolják. A szükséges PNA-ket a szükséges koncentrációban és mennyiségben a megrendelő biztosítja a nyertes ajánlattevő számára az első mintaátadáskor. 16S könyvtárak esetén 1 μL mPNA-t és 1 μL pPNA-t kell hozzáadni az első PCR-hez, és 1 μL mPNA-t és 1 μL pPNA-t a második PCR-hez. A reakció során a megszokott primereket kell használni (a V3-V4 amplikon 16S metabarkódolásához). A ciklusszámok esetén a saját protokollhoz képest emelésre lehet szükség, melyet a megrendelő javasol a minták küldése során. Elvárt minimum követelmények valamennyi szekvenálás esetén: 1. Adatok és minták megőrzése a vizsgálat elvégzését követően legalább 3 hónapig. 2. A beérkező minták minőségi ellenőrzése. A minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, elektronikus fileként Megrendelő rendelkezésére kell bocsátani. Elvárt minimum követelmények a 16S V3-V4 és ITS2 metagenom szekvenálás esetén: 3. A 16S rDNS V3-V4 és ITS2 régióinak amplikon szekvenálása Illumina NovaSeq,vagy azzal egyenértékű platformon PCR, könyvtár készítés, szekvenálás 2 x 300 bp readhosszal és mintánként legalább 100.000 Forward és 100.000 Reverse read lefedettséggel 4. A FastQC Report-ok alapján a szekvenálás során elvárt minimum 80% Q30 minőségi érték minden readre. Elvárt minimum követelmények a teljes bakteriális genom szekvenálás esetén: 5. Bakteriális genom szekvenálása Illumina NextSeq, NovaSeq vagy azzal egyenértékű platformon, paired-end, legalább 2×150 bp 6. Minimális lefedettség: ≥30× 7. Phred score: az olvasatok ≥85%-ára Q30 elvárt 8. De novo assembly elvégzendő (pl. SPAdes vagy egyenértékű) A minták gyűjtése, ill. a minták rendelkezésre bocsátása az Ajánlatkérő feladata, a minták elszállítása a nyertes Ajánlattevő költsége és feladat. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv): a vizsgálati eredmények elektronikus úton eljuttatott (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés), továbbá Ajánlatkérő erre irányuló igénye esetén hivatalos (hitelesített, nyertes ajánlattevő által aláírt, papír alapú) összefoglaló rövid kivonata, amely jegyzőkönyvként szolgál. A nyertes ajánlattevő köteles az eredményeket és a kapcsolódó, előírt információkat elektronikus úton továbbá a hivatalos jegyzőkönyvet elektronikus formában az Ajánlatkérő részére a megadott kapcsolattartó e-mail címére is megküldeni, illetve hivatalos, papír alapú összefoglaló dokumentum igénylése esetén a hivatalos, papír alapú dokumentumot az Ajánlatkérő kapcsolattartójának megadott postacímére megküldeni. Az ezzel kapcsolatos költségeket a vizsgálati díj magában foglalja. A teljesítés során elvárt: Alap bioinformatikai értékelés (FastQC report) és leírása. A genomok esetén kötelezően megadandó assembly mutatók: N50, kontigszám, teljes assembly méret. Az alkalmazott eszközök, módszerek és programok részletes leírása (cikkekben Anyag Módszerként beilleszthető legyen) szükséges. Az alkalmazott eszközök (berendezés típusa), kémia (felhasznált kitek), módszerek (minőség-ellenőrzés, könyvtárkészítés, analízis lépések) és programok (szekvencia generáló, minőségellenőrző, statisztikai és elemző programok) felsorolása szükséges paraméterekkel együtt. A mintákhoz tartozó nyers readek (nyers FASTQ fileok), valamint a bakteriális genomok estén a FASTA file-ok elküldése a Megrendelőnek elektronikus formában. Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 2.Teljesítés határideje: A minták átadásának lehetséges legkésőbbi időpontja: 2028.12.01. A minták átadására a szerződés hatálya alatt - a minták begyűjtésének függvényében - legalább 3, de legfeljebb 6 alkalommal kerül sor. Az első mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap. A mintaátadások időpontját Ajánlatkérő jogosult meghatározni azzal, hogy a mintaátadás időpontjáról a nyertes ajánlattevőt legalább 3 naptári nappal korábban írásban köteles tájékoztatni (megrendelés). A teljesítési határidő a minták átadásától számított 30 munkanap, de legkésőbb 2029.01.31., a finanszírozást biztosító projekt záró időpontjára figyelemmel (amely időpont előbb bekövetkezik). Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási keretszerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya és mennyisége: 180 db rhizoszféra és háttértalaj DNS minta 16S rDNS V3-V4 amplikon szekvenálása. A szolgáltatás igénybevételéhez szükséges közösségi DNS mintákat az Ajánlatkérő biztosítja, minimum 20 μL és ≥10 ng/μl koncentráció mennyiségben (azaz mintánként ≥200 ng összes DNS). 1. Részfeladat: 80 db háttértalaj DNS és rhizozféra talaj DNS 16S V3-V4 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2026.10.12. 2. Részfeladat: 50 db háttértalaj DNS és rhizozféra talaj DNS 16S V3-V4 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2027.10.12. 3. Részfeladat: 50 db háttértalaj DNS és rhizozféra talaj DNS 16S V3-V4 amplikon szekvenálása. A minták átadásának határideje: 2028.10.12. Elvárt minimum követelmények: 1. A 16S rDNS V3-V4 régióinak amplikon szekvenálása Illumina NovaSeq, vagy azzal egyenértékű platformon PCR, könyvtár készítés, szekvenálás 2 x 300 bp readhosszal és mintánként legalább 100.000 Forward és 100.000 Reverse read lefedettséggel. 2. A FastQC Report-ok alapján a szekvenálás során elvárt minimum 80% Q30 minőségi érték minden readre. 3. Adatok és minták megőrzése a vizsgálat elvégzését követően legalább 3 hónapig. 4. A beérkező minták minőségi ellenőrzése. A minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, elektronikus fileként Megrendelő rendelkezésére kell bocsátani. A minták gyűjtése, ill. a minták rendelkezésre bocsátása az Ajánlatkérő feladata, a minták elszállítása a nyertes Ajánlattevő költsége és feladat. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv): a vizsgálati eredmények elektronikus úton eljuttatott (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés), továbbá Ajánlatkérő erre irányuló igénye esetén hivatalos (hitelesített, nyertes ajánlattevő által aláírt, papír alapú) összefoglaló rövid kivonata, amely jegyzőkönyvként szolgál. A nyertes ajánlattevő köteles az eredményeket és a kapcsolódó, előírt információkat elektronikus úton továbbá a hivatalos jegyzőkönyvet elektronikus formában az Ajánlatkérő részére a megadott kapcsolattartó e-mail címére is megküldeni, illetve hivatalos, papír alapú összefoglaló dokumentum igénylése esetén a hivatalos, papír alapú dokumentumot az Ajánlatkérő kapcsolattartójának megadott postacímére megküldeni. Az ezzel kapcsolatos költségeket a vizsgálati díj magában foglalja. A teljesítés során elvárt: Alap bioinformatikai értékelés (FastQC report) és leírása. Az alkalmazott eszközök, módszerek és programok részletes leírása (cikkekben Anyag Módszerként beilleszthető legyen) szükséges. Az alkalmazott eszközök (berendezés típusa), kémia (felhasznált kitek), módszerek (minőség-ellenőrzés, könyvtárkészítés, analízis lépések) és programok (szekvencia generáló, minőségellenőrző, statisztikai és elemző programok) felsorolása szükséges paraméterekkel együtt. A mintákhoz tartozó nyers readek (nyers FASTQ file-ok) elküldése a Megrendelőnek elektronikus formában. Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. 2.Teljesítés határideje: A minták átadásának lehetséges legkésőbbi időpontja: 2028.10.12. A minták átadására a szerződés hatálya alatt - a minták begyűjtésének függvényében - legalább 3, de legfeljebb 6 alkalommal kerül sor. Az első mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap. A mintaátadások időpontját Ajánlatkérő jogosult meghatározni azzal, hogy a mintaátadás időpontjáról a nyertes ajánlattevőt legalább 3 naptári nappal korábban írásban köteles tájékoztatni (megrendelés). A teljesítési határidő a minták átadásától számított 30 munkanap, de legkésőbb 2028. 11.30. a finanszírozást biztosító projekt záró időpontjára figyelemmel (amely időpont előbb bekövetkezik). Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.