Magyarország - Laboratóriumi szolgáltatások - MATE-Laboratóriumi szolgáltatások DBR-2026/I.név

A Magyar Agrár- és Élettudományi Egyetem, mint Ajánlatkérő „MATE Laboratóriumi szolgáltatások DBR” tárgyban, a közbeszerzésekről szóló 2015. évi CXLIII. törvény (továbbiakban: Kbt.) 107. § (1)-(5) bekezdései alapján Dinamikus Beszerzési rendszert hozott létre EKR001148422024 számon, az alábbi főbb kategóriákban: I. Állati -, állati eredetű minták és trágya vizsgálata II. Növényi minták (növényből, növényi anyagból, növényi alapú termékből származó minták) vizsgálata III. Vízvizsgálatok IV. Talaj és környezeti minták vizsgálata V. Molekuláris és biotechnológiai eljárások Ajánlatkérő a Kbt. 107.§ (2) bekezdése alapján a rendszerben megvalósítandó konkrét közbeszerzésekre vonatkozó pontos műszaki leírást és szerződéses feltételeket a DBR-ben részt vevő Ajánlattevők számára az ajánlattételi felhívás megküldésével egyidejűleg bocsátotta rendelkezésre. A jelen tájékoztatóban a 2026. I. negyedéves, a Dinamikus beszerzési rendszerben történt beszerzések lebonyolítására irányuló eljárásokat és azok eredményét teszi közzé Ajánlatkérő a Kbt. 37. § (4) bekezdése alapján. Ajánlatkérő az alábbi eljárást folytatta le: Laborszolgáltatás-03 - Szekvenálás 3, EKR szám: EKR002295132025 Laborszolgáltatás-04 - RRF laborszolgáltatás 1, EKR szám: EKR002389992025 Laborszolgáltatás-05 - Újgen. mikrobiom analízis, EKR szám: EKR000132462026 Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. 1. A beszerzés tárgya, leírása Növényminták mRNS szekvenálása - 28 db egyedi, fagyasztott növényi levélmintán, opcionálisan ajánlatkérő további legfeljebb 8 minta tekintetében jogosult a szolgáltatás megrendelésére Elvárt követelmények: Totál RNS izolálás és QC (Quality Control, azaz minőség-ellenőrzés) • A nyertes ajánlattevő a részére RNALater oldatban, 2 ml térfogatú Eppendorf mintagyűjtő csövekben átadott, fagyasztott növényi mintákból totál RNS-t izoláljon, majd ezeken a templátokon végezzen minőségellenőrzést. • A minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, elektronikus fileként Megrendelő rendelkezésére kell bocsátani. Standard mRNA-Seq elvégzése • A nyertes ajánlattevő a RIN≥7 minőségű totál RNS mintákból mRNS-t tisztítson és fragmentálást követően strand-specifikus könyvtárkészítést végezzen. • Az elkészült poolozott könyvtárak szekvenálása Illumina vagy azzal egyenértékű platformon történjen 2x150 bp PE readekkel, melyet követően a nyertes ajánlattevőnek a nyers adatokat Megrendelő rendelkezésére kell bocsájtani. • A teljes workflow minőségbiztosított módon valósuljon meg, a garantált átlagos paired-end readszám 50 millió/minta legyen. A nyertes ajánlattevő köteles a könyvtárkészítés és minőség-ellenőrzés során kapott eredményeket tartalmazó mérési jegyzőkönyveket, szekvenálási riportokat és FastQ formátumú nyersadatokat Megrendelő rendelkezésére bocsájtani. 2. Elvárt további minimum követelmények: • A mintákhoz tartozó minőségi és mennyiségi vizsgálat eredményei és a szekvenciák elküldése elektronikusan (Illumina basespace felhőben való elhelyezés) történjen a megrendelő számára további bioinformatikai feldolgozás számára megfelelő formátumban • Ajánlatkérő nem kér bioinformatikai feldolgozást. • Ajánlatkérő az eredményeket FastQ file-ok átadásával kéri. • Adatok és minták megőrzése a vizsgálat/elemzés elvégzését követően legalább 3 hónapig elvárt. • Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a teljesítés minden fázisában. A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása, valamint a minták szállítása az Ajánlatkérő feladata. 3. Teljesítés határideje: A minták átadására a szerződés hatálya alatt 1 alkalommal kerül sor. A mintaátadásra a szerződéskötést követő 20 naptári napon belül, a felek által előzetesen egyeztetett időpontban kerül sor. A teljesítési határidő a minták átvételétől számított 40 naptári nap. Ajánlatkérő előteljesítést elfogad. Az opció igénybevételéről Ajánlatkérő a szerződés hatályba lépését követő 10 naptári napon belül írásban tájékoztatja a nyertes ajánlattevőt.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Állati -, állati eredetű minták és trágya vizsgálata/lipidomikai elemzés" szolgáltatási kategóriában, vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. A beszerzés tárgya: Lipid analitikai és lipid analízis 82 db állati szövetmintából. A munka minden mintára kiterjedően, 2 analitikai szakaszban (részletesen alább megadva), és minden paraméterre kiterjedően készüljön el. Az ajánlat és az eredmény is minden, az ajánlatkérő által definiált biológiai paramétert kell tartalmazzon. A minták egy csomagban, egy alkalommal kerülnek átadásra, a nyertes ajánlattevő által megjelölt teljesítési helyen. A mintaszállításról az ajánlatkérő gondoskodik. A mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap, legkésőbbi időpontja a szerződéskötést követő 14. naptári nap azzal, hogy a mintaátadás időpontját ajánlatkérő előzetesen, írásban 3 naptári nappal megjelöli. Az eredmények átadásának határideje: a minták átadásától számított 30 naptári nap; ajánlatkérő előteljesítést elfogad. Az ajánlati ár tartalmazza az analitikai munka, a mintánkénti eredmény, valamint az eredmények elektronikus úton való átadásának ellenértékét. A biológiai mintákból fennmaradó hányad esetleges megsemmisítése, a hulladékkezelés a nyertes ajánlattevőt terheli. Analitikai szakaszok A fagyasztott állati szövetmintákból (maximum 1 g) első lépésben teljes lipidtartalom kivonás, majd pedig az 1. és 2. szakaszok megvalósítása a követelmény: 1. szakasz: minden egyes vese és máj mintából az alábbi lipidfrakciók mennyiségi (targeted analysis) meghatározása: - Szfingozin, - Szfinganin, - Szfingozin-1-foszfát - Szfinganin-1-foszfát. - Szabad ceramid - Szabad koleszterin 2. szakasz: lipidomikai (non targeted) analízis az alább felsorolt minden lipidfrakció esetében (a detektálható molekuláris formák összességére vonatkozóan), mennyiségi meghatározással: - PA - foszfatidsav és származékai - PC - foszfatidil-kolinok és származékaik PE - foszfatidil-etanolaminok és származékaik - PG - foszfatidil-glicerinek és származékaik - PI - foszfatidil-inozitolok és származékaik - PS - foszfatidil-szerinek és származékaik - MAG - monogliceridek - DAG - digliceridek - TAG - triagliceridek - SM - szfingomielinek - CE - koleszterin-észterek - CER - ceramidok - LacCer - lactosylceramidok - HEXCER - hexosylceramidok - CL - kardiolipinek; - NEFA - nem észterezett zsírsavak.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Állati -, állati eredetű minták és trágya vizsgálata/labordiagnosztika/Klinikai kémia" szolgáltatási kategóriában, vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. A beszerzés tárgya: Emésztőenzim-aktivitás és immunválasz paraméterek vizsgálata Enzimaktivitás vizsgálatok: A megrendelő által előállított: - 24 db sertés pancreas fagyasztott mintájából lipáz, össz-proteáz és amiláz enzimek aktivitásának meghatározása; - 24 db sertés duodenum, jejunum és ileum lefagyasztott mintájából kefeszegély maltáz és szacharáz enzimek aktivitásának meghatározása. A mérési eredmények elektronikus úton történő átadása a megrendelőnek. Immunológiai vizsgálatok: A megrendelő által előállított: - 24 db sertés duodenum, jejunum és ileum lefagyasztott mintájából génexpressziós vizsgálatok az alábbi paraméterekre: occludin, claudin-1 és zonula occludens-1, interleukin1-beta (IL-1β), tumor necrosis factor-alpha (TNF-α), interleukin-6 (IL-6), TRL4, NF-kB, NLRP6, Nrf-2 - 24 db sertés máj lefagyasztott mintából génexpressziós vizsgálatok az alábbi paraméterekre: interleukin1-beta (IL-1β), tumor necrosis factor-alpha (TNF-α), interleukin-6 (IL-6), TRL4, NF-kB, NLRP6, Nrf-2, hepcidin; ferritin (könnyű- és nehéz lánc); ERK1; - 24 db sertés máj lefagyasztott mintából: transzferrin, total vas, glutation és glutation peroxidáz, Hsp70 és Hsp 80 - 24 db sertés duodenum, jejunum és ileum lefagyasztott mintájából Hsp70 és Hsp90 (ELISA) meghatározása A vizsgálat módszertanának leírása és a mérési eredmények elektronikus úton történő átadása a megrendelőnek. A munka minden mintára kiterjedően, egy analitikai „csomagban”, és minden paraméterre kiterjedően készüljön el. Az ajánlat és az eredmény is minden, az ajánlatkérő által definiált biológiai paramétert kell tartalmazzon. A minták egy alkalommal kerülnek átadásra. A mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap, legkésőbbi időpontja a szerződéskötést követő 14. naptári nap azzal, hogy a mintaátadás időpontját ajánlatkérő előzetesen, írásban 3 naptári nappal megjelöli. Az eredmények, ill. a módszertani leírás átadási határideje a minták kézhezvételétől számított 30 naptári nap azzal, hogy ajánlatkérő előteljesítést elfogad. A mintákat ajánlatkérő szállítja le a nyertes ajánlattevő által megjelölt teljesítési helyre. Az ajánlati ár tartalmazza az analitikai munka, a mintánkénti eredmény, valamint az eredmények elektronikus úton való átadásának költségét.; Jelen eljárás a hivatkozott DBR keretében, „Molekuláris és biotechnológiai eljárások” szolgáltatási kategóriában, különféle szekvenálások tárgyában vállalkozási szerződés megkötése érdekében kerül kiírásra. A beszerzés tárgya: Fagyasztott sertés bélsár és sertés béltartalom újgenerációs mikrobiom analízise A beszerzés mennyisége: Vizsgálandó minták száma: összesen 250 db, opcionálisan ajánlatkérő további legfeljebb 40 db minta tekintetében jogosult a szolgáltatás megrendelésére. Elvárt minimum követelmények: · DNS izolálása és minőségbiztosítása · DNS könyvtárak elkészítése és minőségellenőrzése · 80 000-200 000 db PE250 Illumina vagy azzal egyenértékű read/minta előállítása · 2x250bp átlagos hosszúságú paired-end dual-index read-ek. · Taxonómai abundanciatáblák, diverzitásindexek előállítása és Krona-diagramok elkészítése A minták gyűjtése, ill. a minták biztosítása a megrendelő feladata. Eredménytermék: Laboratóriumi dokumentáció (vizsgálati eredményeket tartalmazó vizsgálati jegyzőkönyv) megküldése elektronikus formában. (pl. fizikai adathordozó, e-mail csatolmány, felhőben való elhelyezés), továbbá Ajánlatkérő erre irányuló igénye esetén hivatalos (hitelesített, nyertes ajánlattevő által aláírt, papír alapú) összefoglaló rövid kivonata, amely jegyzőkönyvként szolgál. A nyertes ajánlattevő köteles az eredményeket és a kapcsolódó, előírt információkat elektronikus úton, továbbá a hivatalos jegyzőkönyvet elektronikus formában az Ajánlatkérő részére a megadott kapcsolattartó e-mail címére is megküldeni, illetve hivatalos, papír alapú összefoglaló dokumentum igénylése esetén a hivatalos, papír alapú dokumentumot az Ajánlatkérő kapcsolattartójának megadott postacímére megküldeni. Az ezzel kapcsolatos költségeket a vizsgálati díj magában foglalja. A teljesítés során elvárt: Alap bioinformatikai értékelés (FastQC report) és leírása: Az alkalmazott eszközök, módszerek és programok részletes leírása (cikkekben Anyag Módszerként beilleszthető legyen) szükséges. Az alkalmazott eszközök (berendezés típusa), kémia (felhasznált kitek), módszerek (minőség-ellenőrzés, könyvtárkészítés, analízis lépések) és programok (szekvencia generáló, minőségellenőrző, statisztikai és elemző programok) felsorolása szükséges paraméterekkel együtt. Nyertes ajánlattevő konzultációra köteles lehetőséget biztosítani a megrendelés és a teljesítés minden fázisában. A beszerzendő szolgáltatás pontos műszaki leírását és egyéb követelményeket a közbeszerzési dokumentum részeként rendelkezésre bocsátott műszaki leírás tartalmazza. Ajánlatkérő felhívja a gazdasági szereplők figyelmét, hogy amennyiben a megajánlott szolgáltatás a műszaki specifikációja alapján nem felel meg a közbeszerzési dokumentumokban (műszaki leírás) minimum elvárásként előírtaknak, az az ajánlat érvénytelenségét vonja maga után. A minták vizsgálatra történő átadásának a helye az ajánlatkérő vizsgálatot igénylő szervezeti egységének (Élettani és Takarmányozástani Intézet - Takarmánybiztonsági Tanszék) működési helye: 2100 Gödöllő, Páter Károly u. 1., azaz a minták elszállításáról a nyertes ajánlattevőnek kell gondoskodnia. A minták átadásának lehetséges legkésőbbi időpontja: 2016.07.15. A minták átadására a szerződés hatálya alatt - a minták begyűjtésének függvényében - legalább 4 (négy), de legfeljebb 6 (hat) alkalommal kerül sor, egy alkalommal ajánlatkérő min. 30 db minta átadását vállalja. Az első mintaátadás legkorábbi időpontja a szerződéskötést követő 3. naptári nap, legkésőbbi időpontja a szerződéskötést követő 14. naptári nap, azzal, hogy arra a felek által előzetesen egyeztetett időpontban kerül sor, a további mintaátadások időpontját Ajánlatkérő jogosult meghatározni azzal, hogy a mintaátadás időpontjáról a nyertes ajánlattevőt legalább 3 naptári nappal korábban írásban köteles tájékoztatni. A teljesítési határidő a minták átadásától számított 30 naptári nap. Ajánlatkérő előteljesítést elfogad.